Есть основной конфиг nginx.conf, в нем указывается, какие конфиги ты подключаешь, в частности sites-enabled/*.conf - эту директиву можете самостоятельно менять.
Как выше писали , добавляете туда файл с расширением .conf , делаете тест nginx -t , если нет ошибок, то nginx -s reload