Вместо ExtractTextPlugin используй isomorphic-style-loader, пример:
{ test: /\.(sass|scss)$/, use: [
{ loader: "isomorphic-style-loader" },
{ loader: "css-loader", options: { modules: true }},
{ loader: "postcss-loader" },
{ loader: "sass-loader" }
]}
Так решим проблему только со стилями, плюс рабочие css модули.
Честно сам не могу привести сборку server-side на webpack'e в правильный вид. Но видимо webpack-isomorphic-tools решает все эти проблемы.
