Необходимо понять разницу user_id и peer_id
user_id может приходить и из беседы, это будет говорить о том, какой человек конкретно написал. А peer_id -- это идентификатор диалога. Диалог может быть с человеком лично, тогда будет user_id === peer_id, а может и отличаться, когда это беседа.
Всегда берите peer_id, сообщения шлите всегда К peer_id
