Можете еще попробовать phing, это билд система, а не менеджер зависимостей
но и он не подойдет под ваш запрос на 100%
Скажу даже больше - решения которое подошло бы вам в принципе не существует и в других языках, поэтому мой совет - выбирайте максимально легкий для расширения инструмент и допиливайте под свои нужды
