По хорошему каждый микросервис должен работать со своей БД.
А так, разбить микросервисы так, чтобы изменение схемы БД не приводило к изменениям всех микросеврисов.
Ну и писать тесты, тесты и еще раз тесты.
Чтобы не искать где какие таблицы используются, а прогнать тесты и увидеть что где "упало"