1. В каком-нибудь из методов вашего приложения отправляете данные боту по апи (sendMessage?chat_id=..&text=..);
2. Из бота отправляете запрос в ту же базу, какой пользуется ваше приложение.
3. Дальше уже делаете с информацией из базы что пожелаете.
channels.getParticipants
Потом сохраняете юзеров этого канала в базе и при работе пользователя с вашим ботом бегаете в эту базу с айдишником пользователя и проверяете, есть он там или нет.