В общем 2 варианта:
1. Арендуем резервный VDS. Бэкапим tarом диск, по ssh переносим на новый сервер, восстанавливаем. Домен настраиваем на новый сервер. Когда переезд состоится синхронизируем БД через SQLyog. Простой сайта около 30 мин. На старом сервере все обновляем, тестируем. Повторяем переезд. Затраты: аренда нового сервера + дополнительные диски (на месяц). Риск минимален
2. Бэкапим средствами хостинга диск. Накатываем обновления, тестируем. При появлении критичных проблем откатываемся. Простой при проблемах больше чем в 1 варианте и риск больше
Вскоре напишу что из этого вышло...
