lxfr

Может стоит вот так?
sudo /*полный_путь*/dust_s >/dev/null 2>&1

А что мешает просто второй диск воткнуть и примантировать и юзать его? Какие цели вы преследуете? Отделить /home в отдельный раздел?

Попробуйте создавать .lock файл при старте и удалять при завершении и проверять его наличие другим скриптом. Если файл есть значит скрипт либо запущен либо завершен аварийно.

Используя перенаправление портов Iptables, Google "ubuntu перенаправление портов".