Как правило, в sitemap.xml указываются страницы, которые бы вы хотели в ускоренном режиме проиндексировать.
Если не укажете, страшного ничего не произойдет - рано или поздно их найдет поисковой робот и проиндексирует, если они не закрыты от индексации.
Если у вас около 100к страниц - у вас получится 3 файла карты сайта.
В 2-х будут ссылки на страницы (не более 50к в одном), в третьем - ссылки на предыдущие два.
Я разделаю страницы на 3 вида:
1. Важные страницы - для которых необходима индексация;
2. Нейтральные - все равно, будут ли они в выдаче или нет;
3. Скрытые - которые запрещены к индексации.
Соответственно:
1. Эти страницы указываете в sitemap;
2. Эти страницы по желанию;
3. Не указываете и закрываете от индексации, если это необходимо.