Можно в планировщике запускать скрипт, который будет каждые 5 минут обнулять счётчики:
/system scheduler
add interval=5m name=resetcounters on-event="/interface ethernet reset-counters 1" policy=\
write start-time=startup
# 1 - номер интерфейса
Если требуется детальный анализ трафика
Вам потребуется скачать и установить netflow analyzer (
Например)
Нужно включить на микротике traffic flow:
/ip traffic-flow set enabled=yes
указать адрес анализатора
/ip traffic-flow target add address=192.168.1.78:9996 version=9
Более подробно
здесь
У меня эта схема заработала