leon_ti

Если расстояние не больше 100м, то проще соединять коммутаторы медными гигабитными линками.
В приведенных коммутаторах SFP-порты совмещены с двумя последними медными портами: то есть работает либо медь, либо оптика.
На коротких линках использовать оптику не обязательно, если нет особых ситуаций типа переходов по улице или под землей.
Кладите нормальную четырехпарную витуху для межкоммутаторных стыков и всё будет нормально.

P.S.
В конкретно этих коммутаторах все порты — гигабитные, так что выбор портов для транков — вопрос Вашего удобства и единообразия. С технической точки зрения они одинаковы.

1. Сетевые карты с гигабитными SFP портами — штука распространенная. Чтобы система заработала, надо чтобы канальная скорость в оптике поддерживалась сетевухой (грубо говоря, если провайдер по оптике отгружает 100Мбит FastEthernet, а выбранная сетевуха умеет работать только на 1Гбит GigabitEthernet, то система не взлетит).
Уточните скорость канала — сможем посоветовать сетевуху.
Про длины волн вам уже товарищ Opium написал, это не отменяется.

2. По трансиверам. Как уже сказал opium, cisco — самый привиредливый. Хотя по своему опыту могу сказать, что есть коммутаторы Juniper QFX, которые тоже требуют «своих» прошивок, и многие HP тоже капризничают.
Тайваньцы (DLink, Zyxel, Planet) жрут всё, что засунешь.
Ещё иногда капризничают родные Intel-овские сетевые карты с SFP-портами.

Но, как справедливо сказал opium, модули довольно легко перешиваются.