Qt SOAP не совсем родной, он входид в Qt Solutions (в Qt не входит, ситуация с поддержкой не совсем ясная). По моему опыту степень совместимости различных реализаций SOAPа близка к нулевой — то есть, если у вас сервис на .NET и клиент на .NET, то, может быть, все будет работать как должно. Поэтому генерировать запросы вручную — самый простой и надежный способ. Разбирать соответственно тоже вручную, например, с помощью xpath.
Особых проблем это не вызывает, так код формирования и разбора сообщения достаточно абстрактен и пишется один раз.