Kudis

Компонент `bitrix:crm.deal.list` не будет его показывать если передать параметр 'DISABLE_NAVIGATION_BAR' => 'Y'
Нативно это меню исчезает только в слайдере

Там больше и нет ничего. Используйте `OnTaskUpdate`
В нём есть всё, что Вам нужно
в хэндлер придёт 2 параметра $iTaskId и $arFields
внутри будет текущий статус $arFields['STATUS'], когда он равен CTasks::STATE_COMPLETED и не равен $arFields['META:PREV_FIELDS']['STATUS'], значит произошла смена статуса на закрытый

Дальше всё в Ваших руках

Вот так, полагаю:

use Bitrix\Main\Loader;
Loader::includeModule('crm');
$obActivities = CCrmActivity::GetList(
    [],
    [
        'OWNER_TYPE_ID'     => CCrmOwnerType::ResolveID('CONTACT'),
        'COMPLETED' => 'N',
        'CHECK_PERMISSIONS' => 'N'
    ],
    false,
    false,
    [
        'ID'
    ]
);

while ($arActivity = $obActivities->Fetch()) {
    CCrmActivity::Update(
        $arActivity['ID'],
        [
            'COMPLETED' => 'Y'
        ],
        false
    );
}

только советую на одноразового агента повесить, который выполнится не на хитах

Идеально сделать модуль и зарегистрировать один раз хэндлер при установке

EventManager::getInstance()->registerEventHandler(
    'rest',
    'OnRestServiceBuildDescription',
    $this->MODULE_ID,
    'ApiTest',
    'OnRestServiceBuildDescription'
);

Либо регистрировать его каждый раз в `/local/php_interface/init.php` через:

AddEventHandler(
    'rest',
    'OnRestServiceBuildDescription',
    ['ApiTest', 'OnRestServiceBuildDescription'],
    false,
    $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'] . '/habr/ApiTest.php'
);

только не забудьте полный путь к классу прописать (в примере: `/home/bitrix/www/habr/ApiTest.php`)

А потом добавьте ваш scope (Вы его названи `apitest`) в разрешения хука.

Если вы о коробке, то по ссылке:
<домен коробки>/crm/configs/fields/ вы получаете страницу с добавлением пользовательских полей.
Если хотите с этими полями работать через собственные скрипты, то советую создать их из админки <домен коробки>/bitrix/admin/userfield_admin.php, иначе коды свойств не будут осмысленными.
Объект для контактов, при создании поля из админки CRM_CONTACT