Насколько старый диск и как он жил ?
Если он достаточно старый или постоянно нагревался или ударялся, то могла умереть магнитная составляющая. Диск может оставаться виден при установке системы или в биосе, так как контролер еще живет, а хранилище само упало.
Такое еще возможно при скачке напряжения. Например: выключил блок питания при это не завершил сеанс ОС
Попробуй запуститься на лайв образе твоего дистрибутива и попробуй отформатировать разделы,если ошибка сохраняется, то меняй диск.