Если речь идет о указании зависимостей для пакета, тогда Вам в файл control. Подробнее есть тут —
habrahabr.ru/blogs/ubuntu/72633/
Если же хотите в один пакет засунуть две хреновины, то, наверное, можно. Теоретически, создаете структуру каталогов, которая нужна в итоге, туда раскладываете библиотеки и прочие нужные приблуды. Потом рядом создаете папку DEBIAN, в ней делаете файл control, заполняете его. Затем говорите
dpkg -b папка_с_файлами_для_пакета/ ./имя_готового_пакета.deb
Я не знаю, будет ли корректно работать этот вариант, но теоретически — должен.
Можно поступить иначе: пакетам указать нужные зависимости, потом собрать репозиторий со всеми нужными для установки пакетами.
Этот вариант — почти в 2 клика. Надо будет только репозиторий подключить.
