А разве балансовая принадлежность и списки носителей секретных данных не две независимые категории? Вы же бумажные документы на баланс как материальное имущество не ставите? Если документ содержат какие-то секретные данные, то они фиксируются в соотсвутствующих журналах учета носителей секретных данных. И там же фиксируется факт уничтожения с номером акта. Вот также и жесткие диски.
А если журналов учета носителей информации нет, то и акты уничтожения носителей превращаются в фикцию. Как узнать, сколько этих актов должно быть? Все ли акты присутсвуют? Были ли они созданы при уничтожении или написаны потом от балды?..