Выдержка из readme под линукс:
* How do I backup / restore?
1. Make sure UniFi is not running
2. for backup, tar/zip everything inside /path/to/UniFi/data
for restore, untar/unzip everything back to /path/to/UniFi/data
3. restart UniFi
* How do I upgrade?
1. make a backup
2. download the new UniFi-linux.zip and re-install
3. untar/unzip the backup file back
Под windows думаю так же. Еще не забудьте открыть порты на ВМ и ip должен быть из той же подсети. Старый контроллер нужно остановить.
