Станислав Бодро́в

На сколько помню, connlimit работает в цепочке Filter.

Сменился начальник, и многие виды работ заставляет делать после 18:00, когда юзвери уже не работают, при этом время не оплачивается, максимум - отгулы на пол дня, и то будто одолжение делает.

Знакомая песня. Очень. Начальника начинает садиться на шею, забывая, что для этого надо бы раздвинуть ножки. Тут как с гопниками - раз уступишь, не слезет, будет воспринимать как должное, потом как в этом деле поднатореет ещё начнёт указывать что и как делать, диктовать свою лицензионную политику и т. п. Лечится крайне трудно и болезнено. Начиная с обыкновенной перебранки (мата гнушаться не стоит, он итак перестал тебя за человека держать), до прямого и непосредственного обращения в трудовую инспекцию за жалобой (форму обращения и образец заполнения можно найти на просторах интернета). Они с огромной охотой примут обращение и возлюбят начальника. Туда можно написать всё как есть - нарушение условий труда: у вас правильно оборудованная комната приёма пищи?
у тебя полностью соответствует нормам рабочее место?
как там с температурой в помещении?
Поверь, после этого будут бояться пальцем обидеть.

"Ты должен хотеть здесь работать, желать успеха компании, ставить интересы компании выше своих" - говорят человеку с фиксированной зарплатой и решающего задачи, на формирование которых у него нет никакого влияния.

В резервных копиях.

Надо чтобы они каждый день в определенное время обменивались файлами через общую папку

Файлы насколько большие? Если не больше, то по smtp. Иначе - облачный диск: google, yandex, dropbx и т. д. Либо пилите свою VPN сеть.

Пропиши в /etc/rc.d/rc.local
Или настрой в systemd.

Ни один из известных типов технологии RAID (разве что только RAIDZ при соблюдении ряда условий) не даёт гарантии целостности и сохранности данных.

Проще посоветовать, во что не вступать - zabbix, nagios. Там всё сложно, крайне монструозно и вырвиглазно.
Лучше что-то по новее, по проще. И красивще