jcmvbkbc

gpg --list-keys
pub 4096R/353AE8AA 2020-07-13

Это публичный ключ. И команда выводит только публичные ключи. Приватные ключи можно посмотреть через gpg --list-secret-keys

при попытке подписать rpm его не видит. Какие возможные причины?
gpg: signing failed: No secret key

Для подписи нужен приватный ключ, о чём gpg и говорит.

Но при проверки им
gpg --verify ncopa.asc alpine-standard-3.9.0-x86_64.iso.sha256
пишет что gpg: verify signatures failed: Неожиданная ошибка.

alpine-standard-3.9.0-x86_64.iso.sha256 -- это просто sha256 от iso, там нет подписи. Подпись должна быть в файле с расширением .asc за кнопкой "GPG", но там 404.
Судя по содержимому dl-cdn.alpinelinux.org/alpine/v3.9/releases/x86_64 подписи всё-таки есть для некоторых .iso