jcmvbkbc

lsusb и lspci не видят его

и это правильно, потому что, судя по dmesg, это i2c устройство подключенное к i2c-контроллеру висящему на шине PCI (вот к этому: 00:15.1 Serial bus controller: Intel Corporation Cannon Point-LP Serial IO I2C Controller #1 (rev 30)).

Что делать в такой ситуации?

Добавить пользователя который выполняет этот скрипт в /etc/sudoers с флагом NOPASSWD. Костыли убрать:

username ALL=(ALL:ALL) NOPASSWD: ALL

Для большинства опций -- будет переписано последним переданным значением. В частности это справедливо для -march и -mtune на x86.
Но в общем случае может быть что угодно, поскольку gcc может преобразовывать одни опции в другие согласно своим спекам перед вызовом собственно компилятора.

Открой для себя buildroot.