Миша Петров

Разобраться в сущностях предметной области - с чем мы имеем дело. Какие у них, у сущностей, есть свойства, какие из них для нас важны, а какие нет. Как эти сущности связаны друг с другом. Концептуальная модель предметной области, по-хорошему оформляется графической схемой с пояснениями. Потом разобрать по возможности все варианты использования - кто будет использовать, зачем, какая информация должна быть получена и какие изменения в данных должны произойти . Use cases называется. Потом уже исходя из этого всё остальное, что здесь сказано.
Если этот этап пропустить, то за день до сдачи запросто можно обнаружить, что имеющаяся структура БД в принципе не позволяет решить ту задачу, которая для заказчика важнее всего, и что структуру данных надо переделывать, а весь написанный под нее код - переписывать с нуля.

По алгоритмам и структурам данных - классика, но на мой взгляд, не утратила актуальности - Никлаус Вирт, "Программы = алгоритмы + структуры данных". Старая, еще до ООП. Довольно компактная и очень ясно написанная. Есть несколько вариантов, где в примерах используются разные языки (начиная с паскаля), но в конкретный язык не упирается - фокус на общих принципах.
По ООП - Гради Буч, "Объектно-ориентированное проектирование" - тоже классика по ООП, первоисточник.
Вообще классическая классика по программированию - Кнут, "Программирование" - но это надо быть героем. 10 томов, где 10000 алгоритмов разобраны и изложены на языке уровня ассемблера.