ЧЕРЕЗ Tomcat7-plugin так и не получилось запустить. Но мои зависимости увидел полноценный Tomcat9, в проекте я использовал динамический веб модуль 3.1. Настройки через Spring Аннотации. Много модульный проект. Установка tomcat происходила по этому видео:
https://youtu.be/QWLjhk6LeSQ
А потом деплоил вручную. Не очень удобно. Интересно есть ли способ связать полноценный Tomcat9 с Eclipse чтобы проект запускать из IDE. (я пытался ставить модуль tomcat 9 на Eclipse, он тоже не видит мою зависимость из другого под модуля, только полноценный видит).