Коллега, покажите секцию Ipsec из MT (убрав приватные данные, разумеется), похоже таймаут чего либо или же ошибка в конфигурации \ баг.
Так же самостоятельно проверьте
msdn.microsoft.com/library/azure/jj156075.aspx#BKM... все параметры по первой колонке.
