Все оказалось просто
Сделал с помощью
cursor()
var bigData = [];
var cursor = Model.find(obj).select(obj).populate(str).cursor({batchSize:100});
cursor.
on('data', doc => {
if(doc) {
bigData.push(doc);
}
})
.on('end', () => {
// производим дальнейшие действия с данными
})