Извините, но с такими познаниями битрикса вам будет тяжело. Работа с шаблоном сайта: это база. Там нет ничего сложного, можно за пару часов все изучить и понять. Но это нужно знать.
Так же, если вы не знаете как выделить в верстке выделить шапку и подвал: значит вы и с интеграцией верстки в любые шаблоны любых систем на вы.
С таким уровнем знаний, сначала нужно подтянуть базу знаний.
В документации битрикса есть множество курсов, один из них как раз про шаблон дизайна сайта, т. е. ваш случай:
dev.1c-bitrix.ru/learning/course/index.php?COURSE_... 