У меня 3100 товаров. Куча категорий и меток. Очень много фильтров в сайдбаре. Все работает отлично. Недавно читал о тестировании woocommerce с 50 000 товарами и все было в пределах нормы. Кроме того, сам полазил по различным сайтам и увидел что на том же опенкарт или мадженто тоже можно убить сервер))) Попадались жесткие черепахи (или динозавры). Если не ошибаюсь, мадженто намного больше запросов создает в сравнении с вукомерс по умолчанию. На крайняк можно поставить плагин Хард Бит Контрол для регулировки частоты запросов.
