hint000

В общем случае пробелы экранируют кавычками. В вашем коде и так почти везде переменные взяты в кавычки, но есть участок, где это не так; попробуйте взять в кавычки $1 и $i вот здесь:

for i in `find $1 -type f`
do
    # Получаем кодировку очередного файла
    cod=`enca -L ru $i`

Заниматься реальным тестированием скрипта мне сейчас лень, просто надеюсь, что догадка сработает.

Это учетка Администратор.

Создайте новую учётку, назначте права администратора. Попробуйте войти под новой учёткой. Если всё нормально, то перенесите нужные данные (если такие есть) со старого профиля и после этого удалите старую учётку, затем удалите папку с кривым именем.

В чём причина такого глюка непонятно, но если это случилось только один раз и больше не повторяется, то и чёрт с ним. Каких только глюков не бывает на винде. Для спокойствия можно прогнать проверку командой sfc /scannow, прогнать тест оперативки, тест логической целостности файловой системы, глянуть SMART на диске. Вот если будет повторяться, тогда это повод для расследования.

Если через PuTTY подключаетесь, то вот:

Это применит настройку к текущему подключению. Если не хотите каждый раз лазить в настройки, то сохраните это в параметры соединения по-умолчанию.
Если не через PuTTY, то уточняйте, через какой ssh-клиент подключаетесь.