Выбирал для своего магазина — остановился на робокассе. Наиболее простой и понятный интерфейс, больше всего способов оплаты. Проценты одни из самых больших — 5%.
Но посчитал, что лучше получить больше заказов и довольных покупателей, чем сэкономить 2% (а 3% предлагает, например, интеллектмани).