Можно конечно и rsync'ом воспользоваться. Его вполне просто использовать rsync [что] [куда].
Настраиваете
ssh без пароля, прописываете хост в ~/.ssh/config и потом просто сливаете
rsync --progress -avz -e ssh yourserver:/home/user/www/project/ /home/user/www/project/
ну и так же заливаете
rsync --progress -avz -e ssh /home/user/www/project/ yourserver:/home/user/www/project/
Но лучше git :)