ggruno

Сделай проси через nginx на любой другой порт к своему контейнеру
Ии будешь к контейнер обращаться через nginx по 443

Sh script.sh &&

Там есть центр приложений можно как скачать новое так и удалить.gui-шный
Ну или в программе должно быть раздел "О программе" и там будет написано ее имя и потом уже apt purge "имя пакета "
Apt autoremove

А скрипт из под рута запускается ? попробуй отдать файл пользователю из под которого надо стартовать скрипт

Shutdown now ?

Sleep ?
Xdotool