Сам спросил - сам отвечаю.
Был создан список в файле hosts, чтобы скайп не показывал рекламу. После обновления скайпа, видимо, ему перестало это нравится и появилось это окно.
P.S. Теперь достаточно одной строки в hosts, чтобы не видеть рекламу:
127.0.0.2 apps.skype.com
