Для начала, прекратить все делать через задницу, и начать делать правильно - собирать пакеты с указанием зависимостей.
Не нужно превращать отлаженную систему с менеджером пакетов в помойку а-ля венда, куда любой желающий тащит свои библиотеки.
Потому что потом ваш самопальный GTK не найдет уже какую-то свою зависимость и все покатиться.
