Выше многие написали, что для поисковиков без разницы. Это неверно. На сайт обычно много ссылок c URL в анкоре, то есть вида mysite.com, при этом сайт продвигается по ключевому слову "mysite". Если ссылки будут вида my-site.com, то сайт будет продвигаться по 2 ключевым словам: "my site" != "mysite".
