1)Это будет называться не модификатор, а элемент.
2)
nav-menu__li, поскольку, как было сказано, меню будет использоваться несколько раз внутри разных блоков.
3)Навигацию рекомендуется делать списком, то есть
<nav>
<ul>
<li><a href=""></a></li>
<li><a href=""></a></li>
<li><a href=""></a></li>
<li><a href=""></a></li>
</ul>
</nav>
4)Если данная навигация будет использоваться в разных местах в одном и том же виде, то ей не нужен класс
.content-header__nav