В принимающей базе можно создать foreign table на таблицу из базы-источника и потом выполнить следующий запрос в принимающей базе.
insert into target_table(col1, col2)
select col1, col2
from source_foreign_table
/* where some condition */
www.postgresql.org/docs/9.3/static/sql-createforei...