Да никуда Java не пропадет в ближайшем обозримом будущем.
Ибо пока нет других языков и VM обеспечивающих сравнимую кросс-платформенность.
Язык вполне популярен, под него существует огромное количество библиотек и готовых продуктов.
Из известных GUI-приложений можно назвать платформу Eclipse и производные продукты на основе это платформы. Например:
List of Eclipse-based software.
В ближайшем будущем, более вероятно, появится большее количество производных языков (напр. Scala), которые будут генерировать байт-код для JVM.
Т.е. возможно, что Java, как язык, будет постепенно снижать популярность, но JVM, скорее всего, останется надолго.