eee

Раскомментируйте виртуальные свойства, с ними все в порядке.
Вы неправильно вызываете навигационные свойства. Должно быть так:

// Сначала находим нужное нам сообщение
var message = context.Messages.Find(Id);

// Затем мы можем получить навигационные свойства этой записи
var createdByUserName = message.CreatedBy.Name;
var updatedByUserName = message.UpdatedBy.Name;

// Получить другие сообщения автора данного сообщения
var creatorMessages = message.CreatedBy.CreatedMessages.ToList();