dnscrypt-proxy первой версии на OpenWrt по умолчанию конфигурируется через интерфейс uCI, а не через стандартный конфиг, как на остальных системах Linux. Файл конфигурации находится там же, где и другие конфиги uCI:
/etc/config/dnscrypt-proxy.
Документация по настройкам здесь:
https://openwrt.org/docs/guide-user/services/dns/d... 
