Как вариант, запустить на сервере столько mysqld, сколько менеджеров и настроить обычную master-slave репликацию. Дальше, получив на одном сервере множество «актуальных» баз, — писать скрипт синхронизации.
P.S. Я уже год как устал ждать
forge.mysql.com/worklog/task.php?id=1697