deadkEEper1

В принципе, перед тем как делать документ из колекции активным, можно перед этим поискать в колекции уже сушествующий документ для которого active: true и изменить его на false. А уже после сделать активвным нужный.
С monggose будет выглядить примерно так:

var idToUpdate = 1;

mongoModel.findOneAndUpdate({active: true}, {active: false}, function(err, result){
    if(!err){
        mongoModel.update({_id: idToUpdate }, {active: true}, function(err, result){
                  console.log('Updated')
})
}
})