На самом деле, лучше убрать без создания новой схемы:
Settings > Editor > Apperance > Show method separators
P.S. А выбор цвета для разделителя, совпадающий с фоном, я бы делать не советовал, а то вдруг захотите его все-таки включить и (вдруг!) не увидите изменений.