Проблему решил, оказалось что дело в политике безопасности PowerShell.
Если выполнить
Set-ExecutionPolicy RemoteSigned
то проблема устраняется
Вернуть назад можно вот так
Set-ExecutionPolicy Restricted
В общем, нужно копать в сторону разрешения выполнения определённых скриптов, у меня они лежат в папке C:\usr\TfsAgents\tasks