Сергей

Есть официальная документация по yii2.

Если вы устанавливали advanced версию, то не забудьте запустить init script в корне проекта в терминале.

Ну и конфиги описанные Вами - это конфиги фрэймворка, а не докера. (ну, мало ли, вдруг Вы перепутали)

Это не нормально, я думаю.
Значит есть права на чтение у других юзеров или у группы этих юзеров.