Я когда-то делал подобное, но с физической машиной. На виртуалке все тоже самое.
Мануальчик прикладываю. Писал для себя, но нужное думаю вы поймете.
1. На чистой машине, грузимся с livecd.
Размечаем через cfdisk разделы на жестком диске
cfdisk /dev/sda
Делаем первый раздел загрузочным
2. Форматируем разделы на ext3
mkfs.ext3 /dev/sda1
mkfs.ext3 /dev/sda5
mkfs.ext3 /dev/sda6 итд.
3. Создаем в каталоге /mnt директории
mkdir /mnt/backup
mkdir /mnt/root
4. Монтируем диск с бэкапом и новый раздел root
mount /dev/hda1 /mnt/root
mount /dev/sda1 /mnt/backup/
5. Распаковываем с архива раздел root
tar -xvpf /mnt/backup/root.260314.tar --directory=/mnt/root
6. Создаем отсутствующие директории
mkdir /mnt/root/usr
mkdir /mnt/root/var
mkdir /mnt/root/proc
mkdir /mnt/root/sys
mkdir /mnt/root/mnt
7. Монтируем разделы /usr и /var
mount /dev/hda7 /mnt/root/usr
mount /dev/hda8 /mnt/root/var
8. Распаковываем с архива разделы /usr и /var
tar -xvpf /mnt/backup/.usr.260314.tar --directory=/mnt/root/usr
tar -xvpf /mnt/backup/var.260314.tar --directory=/mnt/root/var
9. Создаем каталог /var/spool
mkdir /mnt/root/var/spool
10. Монтируем и распаковываем из архива раздел /var/spool
mount /dev/hda9 /mnt/root/var/spool
tar -xvpf /mnt/backup/spool.260314.tar --directory=/mnt/root/var/spool
11. Правим /etc/fstab и /boot/grub/device.map
12. Восстанавливаем загрузчик
mount --bind /dev /mnt/root/dev
mount --bind /proc /mnt/root/proc
mount --bind /sys /mnt/root/sys
chroot /mnt/root bash
grub-install /dev/sda
update-grub
exit
13. Перегружаемся и восстанавливаем из архива базы MySQL
