Создаёте новый проект, активируете VCS (Enable VCS), создаёте новый репозиторий Git, добавляете в него нужные файлы, делаете коммит, далее в VCS выбираете Import Into Version Control -> Share Project in GitHub.
Это будет работать при условии что у Вас корректно настроены VCS в Settings -> Version Control.