b3er

Вот здесь всё вроде бы понятно написано
https://developer.android.com/studio/command-line/...

Попробуйте перед импортом проекта удалить плагин idea из build.gradle и все *.iml/*.iws/.idea файлы.
На данный момент поддержка gradle в idea работает из коробки, без необходимости генерации idea файлов самим gradle.