Создайте дополнительный раздел с tmpfs и при каждом запуске сервера делайте синхронизацию базы на этот раздел. Но вся база у вас не влезет, поэтому выделяйте партицию, которая влезет в раздел. И читайте с этого раздела. Конечно, это тоже прогрев, но он происходит только при перезапуске сервера.