Проверьте, не стоит ли ограничение на индексацию сайта в robots.txt, так же рекомендую проверить нет ли в метатегах сайта такого тега , если есть удалите.
Стоит добавить сайт в Яндекс.Вебмастер и Google Search Console, через время после добавления Вам сообщат причину отсутствия сайта в индексе.
При всем этом, на сайте могут находится вирусы, обычно сайты с вирусами убираются из индекса поисковых систем.
