Поля формы для массивов должны иметь такой вид:
<th><input type="text" name="code[<?php echo $i; ?>]" value="" class="form-control" placeholder="Артикул"></th>
<th><input type="text" name="name[<?php echo $i; ?>]" value="" class="form-control" placeholder="Наименование"></th>
<th><input type="text" name="groups[<?php echo $i; ?>]" value="" class="form-control" placeholder="Группа товара"></th>
<th><input type="text" name="unit[<?php echo $i; ?>]" value="" class="form-control" placeholder="Ед. измерения"></th></tr>
В результате в 1c.php вы получите в $_POST эти четыре массива с данными:
code
name
groups
unit