Сохраняю и закрываю файл .bashrc.
Прописываю в терминале source ~/.bashrc
Потом еще раз ввожу команду cp и выскакивает ошибка, что не известна команда rsync.
То есть, изменения из .bashrc не вступили в силу?
судя по тому что написано, команды rsync у вас нет
сделать надо $ whereis rsync
и если вывод будет похож на этот:
rsync: /usr/bin/rsync /usr/share/man/man1/rsync.1.gz
то все хорошо и rsync установлен, тогда
$ unalias cp || alias cp='/usr/bin/rsync -avz -P'
